​艾格偌育种信息管理系统

2020-02-18 14:19
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艾格偌育种信息管理系统是在中国农业大学王向峰教授的专业数据统计分析团队支持下开发,面向育种单位和个人推出的育种信息化全程管理软件。

本系统实现了种质资源信息管理、种质资源实体库管理、育种圃管理、试验设计、试验数据管理、田间数据采集APP、数据汇总、表型数据分析、基因型数据分析、动态地图、图片视频管理、试验报告管理、数据查询、资源评价等育种全流程信息化闭环管理。

艾格偌育种信息管理系统软件分为企业定制专业版和公共版


适用对象

种业育种部门、种业测试部门、联合体组织和承接单位、各相关科研院所及高校、个人试验点等


适用范围

玉米、水稻、小麦、大豆,蔬菜、及各种经济作物等


通过WEB和APP相互配合使用

功能模块

一、资源信息管理

资源信息管理

1.资源属性管理

2.资源设置

3.资源材料管理

4.杂交材料管理

二、资源实体库管理

1.资源单位设置

2.库位信息管理

3.库存信息

4.入库管理

5.出库管理

三、育种圃

1.观察圃

2.DH圃

3.选系圃

4.亲本扩繁圃

5.测配圃

6.复配圃

7.产量测试计划

四、试验设计

1.随机区组设计

2.间比法设计

3.若干区组设计

4.增广试验设计

5.拉丁方设计

6.裂区设计

五、试验数据管理

1.试验数据管理

2.试验种植图

3.试验数据维护

4.种子校对

六、数据汇总

结合试验设计分类,对纷繁复杂的数据进行自定义汇总,输出数据表格,一目了然

七、动态地图


 试验任务地理位置标记:动态标记试验地点,便于查看

产品地理位置表现:可以通过不同颜色标记不同地点的表现情况

八、表型数据分析

1.数据探索性分析:异常值检验、描述性统计、相关性分析、线性模型假设、数据转换

区域试验统计分析描述性统计分析(区)、品种评价(方差分析、丰产性和稳定性分析、试点分析、遗传力分析、基本统计、性状分析)、试验评价、可视化作图)(田间种植图、农艺性状田间分布图、异常值诊断图、品种均值图、品种试点均值图、品种试点互作效应图、品种均值CV图、品种均值Shukla方差图、品种均值RSD图、AMMI双标图、试点均值鉴别力图)

2.完全随机区组设计:单点分析(方差分析、混合线性模型BLUP值、混合线性模型BLUE值、空间分析BLUP值、空间分析BLUE值、系谱分析、系谱空间分析、多性状混合线性模型BLUP值、多性状系谱分析)多点分析(方差分析、混合线性模型BLUP值、混合线性模型BLUE值、系谱分析、多性状混合线性模型BLUP值、多性状系谱分析)

3.完全随机设计:单点分析(方差分析、混合线性模型BLUP值、空间分析BLUP值、空间分析BLUE值、系谱分析、系谱空间分析、多性状混合线性模型BLUP值、多性状系谱分析)多点分析(方差分析、混合线性模型BLUP值、系谱分析、多性状混合线性模型BLUP值、多性状系谱分析)

4.拉丁方设计:单点分析(方差分析、混合线性模型BLUP值、混合线性模型BLUE值、系谱分析、多性状混合线性模型BLUP值、多性状系谱分析)多点分析(方差分析、混合线性模型BLUE值)

5.裂区设计:单点分析(方差分析、混合线性模型BLUE值)多点分析(方差分析、混合线性模型BLUE值)

6.增广随机区组设计:单点分析(方差分析、混合线性模型BLUP值、混合线性模型BLUE值、空间分析BLUP值、空间分析BLUE值、空间分析行列效应BLUP值、系谱分析、系谱空间分析、系谱空间行列效应分析、多性状混合线性模型BLUP值、多性状系谱分析)多点分析(方差分析、混合线性模型BLUP值、混合线性模型BLUE值、系谱分析、多性状混合线性模型BLUP值、多性状系谱分析)

7.配合力分析:NCII设计分析、双列杂交分析

8.可视化分析:试点热图、箱线图、 小提琴图、 品种折线图、 品种热点聚类图、 品种均值图、品种回归图、表型诊断图、AMMI、GGE双标图、品种适应图、雷达图、Q-Q图、系谱图



九、基因型数据分析

1.基因型数据分析:标记的筛选、遗传关系、群体结构分析、主成分分析、进化树构建、遗传多样性分析

2.基因组数据库:序列提取比对;基因注释信息,包括基因结构、编码起始位置、功能注释等;重复区域标识;选择性剪切事件;其他比对到基因组上的数据,如Indel、QTL位点、SNP位点等

3.全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS):在全基因组范围内筛选可能影响目标农艺性状的遗传变异,(基因型数据及其与表型数据相结合的分析,普遍适用于样本量<1万,标记数<50万)。GLM方法、MLM方法、CMLM方法、P3D方法、Farm-CPU方法

4.数量性状基因定位:遗传图谱的构建、QTL定位分析

5.全基因组选择分析(Genomic selection, GS):BLUP方、贝叶斯方法、机器学习方法

6.可视化分析:杂合率直方图、LD散点图、标记密度分布图、亲缘关系热图、structure图、PCA图、进化树图、预测精度散点图和箱线图、曼哈顿图、Q-Q图、基因型分布图、标记偏分离曲线图、重组率分布热图、遗传图谱、QTL图


十、图片&视频管理


1.图片&视频分期设定

2.图片&视频查看

3.图片&视频维护

4.图片水印

十一、数据报告管理

快速生成word版报告

十二、APP管理部分

1.田间数据采集,上传及下载

2.性状管理:性状选择、只读性状、性状排序、性状筛选、主副性状设置

3.常用词管理:添加及管理常用短语,可快速输入短语

4.走向方式:包含升序、降序、龙摆尾等走向方式

5.种植图:查看电脑端生成的种植图或导入的种植图文件

6.预览:根据排区号对数据进行平面查看

7.调查表页面切换:横竖调查页面切换

8.扫码跳转:输入或者扫描一二维码进行位置跳转

9.批量录入:数据批量录入功能

10.图片设置:图片分期设置、图片水印设置(包含小区信息及经纬度等)

11.中英文切换:支持中英文界面

12.育种圃管理:在田间使用平板或手机直接记录收获情况,推到入库申请,经过审核,资源进级,重新命名

13.资源信息管理

14实体库管理




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